MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018 chromosome

Total Repeats: 17148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007705	GC	3	6	6	11	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007705	CAGC	2	8	14	21	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007705	GAT	2	6	26	31	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007705	CCA	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007705	AAAC	2	8	1544	1551	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007705	CAC	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007705	GTT	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007705	GC	3	6	2872	2877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007705	CGC	2	6	2971	2976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007705	CA	3	6	3014	3019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007705	CTG	2	6	3090	3095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007705	CG	4	8	3105	3112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007705	G	6	6	3146	3151	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007705	CGG	2	6	3175	3180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007705	AG	3	6	3199	3204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007705	CAAT	2	8	3313	3320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007705	GTCC	2	8	3334	3341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007705	CAG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007705	TC	3	6	3363	3368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007705	CTT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007705	TTG	2	6	3538	3543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007705	ATC	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007705	GAT	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007705	GTT	3	9	3768	3776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007705	CCTG	2	8	3891	3898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007705	CCGT	2	8	3906	3913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007705	C	6	6	5149	5154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_007705	TGT	2	6	5195	5200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007705	CCA	2	6	7665	7670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007705	CGGTG	2	10	7707	7716	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007705	GAC	2	6	7724	7729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007705	CGG	2	6	8677	8682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007705	GCCT	2	8	9622	9629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007705	TCG	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007705	CGG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007705	ATC	2	6	11139	11144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007705	TCA	2	6	11910	11915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007705	CA	4	8	11917	11924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007705	CAACA	2	10	13607	13616	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007705	T	7	7	13655	13661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007705	TGT	2	6	13667	13672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007705	GCGA	2	8	13744	13751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007705	GCT	2	6	13754	13759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007705	GCA	2	6	13791	13796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007705	CG	3	6	13818	13823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007705	GCGCC	2	10	14990	14999	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_007705	TCG	2	6	16883	16888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007705	AAAG	2	8	16927	16934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007705	CGA	2	6	16997	17002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007705	GTC	2	6	17003	17008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007705	A	7	7	17074	17080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007705	GCT	2	6	17083	17088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007705	GCC	2	6	18151	18156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007705	TG	3	6	18222	18227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007705	A	7	7	18320	18326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007705	GC	3	6	18338	18343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007705	GCT	2	6	19632	19637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007705	ACT	2	6	19645	19650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007705	AGC	2	6	19658	19663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007705	CAA	2	6	19697	19702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007705	GCC	2	6	22426	22431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007705	AAC	2	6	23052	23057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007705	GTT	2	6	24168	24173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007705	GCG	3	9	25367	25375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007705	TGCC	2	8	25463	25470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007705	TGGC	2	8	25488	25495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007705	TGG	2	6	26092	26097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007705	TGCG	2	8	26172	26179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007705	ACC	2	6	26914	26919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_007705	GTC	2	6	26972	26977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007705	GTC	2	6	26979	26984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007705	GCG	2	6	26994	26999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007705	GCG	2	6	27427	27432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007705	GCG	2	6	27454	27459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007705	CG	4	8	27482	27489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007705	GCC	2	6	27506	27511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007705	GA	3	6	28757	28762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007705	TGC	2	6	28791	28796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007705	CAG	2	6	28809	28814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007705	GC	3	6	28995	29000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007705	CTG	2	6	29018	29023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007705	GTG	2	6	29047	29052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007705	CCG	2	6	29071	29076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007705	CGT	2	6	29099	29104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007705	GTG	2	6	29131	29136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007705	CGC	2	6	29173	29178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007705	AAC	2	6	29214	29219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007705	CG	3	6	29241	29246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007705	GC	3	6	29260	29265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007705	GCT	2	6	29285	29290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007705	TG	3	6	30414	30419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007705	GGA	2	6	30434	30439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007705	GGC	2	6	30493	30498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007705	ATG	2	6	30506	30511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007705	TGA	2	6	30598	30603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007705	CGT	2	6	30604	30609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007705	CGG	2	6	30616	30621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007705	TCAC	2	8	30630	30637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007705	GGGAG	2	10	30670	30679	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007705	GGC	2	6	31013	31018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007705	GCA	2	6	31038	31043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007705	AGT	3	9	31069	31077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007705	AAC	2	6	31167	31172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007705	CAC	2	6	31174	31179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_007705	GAG	2	6	31207	31212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007705	TGC	2	6	32188	32193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007705	GGC	2	6	32196	32201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007705	AAG	2	6	32268	32273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007705	GTT	2	6	32297	32302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007705	CCTT	2	8	32307	32314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007705	GATT	2	8	32343	32350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007705	TGA	2	6	32362	32367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007705	GTT	2	6	32378	32383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007705	GC	3	6	32393	32398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007705	TGG	2	6	32403	32408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007705	GTA	2	6	32433	32438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007705	CGT	2	6	32440	32445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007705	GAT	2	6	32521	32526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007705	TG	3	6	32579	32584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007705	TGT	2	6	32595	32600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007705	CTG	3	9	32602	32610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007705	GGGC	2	8	32635	32642	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007705	TTA	2	6	32658	32663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007705	CCA	2	6	34593	34598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_007705	CCG	2	6	34618	34623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007705	AC	3	6	34710	34715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007705	GT	3	6	34735	34740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007705	CTCG	2	8	34743	34750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007705	ATG	2	6	34779	34784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007705	GCA	2	6	34840	34845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007705	TGT	2	6	34855	34860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007705	CGC	2	6	34865	34870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_007705	CAGC	2	8	34982	34989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007705	GCT	2	6	34993	34998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007705	GAT	2	6	35030	35035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007705	CCA	3	9	35080	35088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007705	CTG	2	6	37754	37759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007705	CGC	2	6	37763	37768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007705	CCG	2	6	39010	39015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_007705	GCC	2	6	39050	39055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_007705	GCC	2	6	39059	39064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_007705	GCG	2	6	39461	39466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007705	ATGC	2	8	39538	39545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007705	GCG	2	6	39586	39591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007705	TG	3	6	39613	39618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007705	T	6	6	40319	40324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_007705	CA	3	6	41621	41626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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191	NC_007705	CGG	2	6	47877	47882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_007705	GCAT	2	8	84841	84848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
290	NC_007705	GC	3	6	84869	84874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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294	NC_007705	CAT	2	6	84973	84978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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417	NC_007705	AGG	2	6	122216	122221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_007705	GCA	2	6	124048	124053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_007705	TGC	2	6	124082	124087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_007705	GC	3	6	124117	124122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
424	NC_007705	CAAGC	2	10	125092	125101	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
425	NC_007705	GGC	3	9	125168	125176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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